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Servicebio Plant Tissue Direct PCR Kit是一款專為不同類型植物組織直接進行PCR所設計的產品,無需基因組DNA提取,只需簡單處理可直接作為PCR擴增的模板,對於普通植物樣本及多糖多酚植物樣本均可兼容。
本試劑盒提供的2×Plant Direct PCR Master Mix專門針對植物組織樣本直接擴增進行了優化,大大提高了擴增效率及抗抑制劑效果。此外,該試劑包含了PCR擴增除模板和引物外的所有組分,並添加了Loading Dye,擴增產物可直接點樣電泳,大大簡化了操作過程。該產品的簡便性和強兼容性可用於快速轉基因植株鑒定、植物基因分型等分子生物學實驗。
內容物
Component Number |
Component |
G3313-01 |
G3313-1 |
2×Plant Direct PCR Master Mix |
1 mL |
G3313-2 |
Lysis Buffer A |
5 mL |
G3313-3 |
Lysis Buffer B |
4 mL |
G3313-4 |
Direct PCR Enhancer |
500 μL |
G3313-5 |
Nuclease-free Water |
5 mL |
實驗步驟
1. 植物組織裂解後擴增
1)取5 mm2左右的植物葉片(推薦使用新鮮幼嫩的植物葉片)或5 mg的種子(對於堅硬種子可先用研磨儀或研缽研磨成粉末狀)於Nuclease-free離心管中,加入50 μL Lysis Buffer A,用槍頭或其他方式將植物樣本搗碎(如:煙草葉片搗碎後溶液變為綠色;研磨成粉末的種子樣本用槍頭攪拌均勻),於室溫下靜置5 min。
2)加入40 μL Lysis Buffer B,渦旋振蕩或吹打混勻後離心,將沈澱收集到管底,取上清,用Nuclease-free Water稀釋5倍後作為模板備用。
3)推薦PCR反應體系:
Component |
20 μL rxn |
Final Concentration |
2×Plant Direct PCR Master Mix |
10 μL |
1× |
Forward Primer (10 μM)a |
0.8 μL |
0.4 μM |
Reverse Primer (10 μM)a |
0.8 μL |
0.4 μM |
Templateb |
Variable(≤4 μL) |
|
Nuclease-free Water |
Add to 20 μL |
a. 引物終濃度使用範圍0.2~1.0 μM,推薦引物濃度為0.4 μM,過少的引物可能會導致擴增產量低或無擴增,過量的引物可能會導致非特異擴增。
b. 一般20 μL體系中加入2 μL稀釋5倍後的裂解液時可獲得較好的結果,可根據植物樣本裂解的難易程度調整模板加入量,加入量不超過4 μL。
2. 植物葉片直接擴增(推薦PCR反應體系)a:
Component |
50 μL rxn |
Final Concentration |
2×Plant Direct PCR Master Mix |
25 μL |
1× |
Direct PCR Enhancer |
10 μL |
|
Forward Primer (10 μM)b |
2 μL |
0.4 μM |
Reverse Primer (10 μM)b |
2 μL |
0.4 μM |
Templatec |
1 mm2 |
|
Nuclease-free Water |
Add to 50 μL |
a. 植物葉片直接擴增僅適用於1 kb以下片段擴增,推薦使用新鮮幼嫩的植物葉片。
b. 引物終濃度使用範圍0.2~1.0 μM,推薦引物濃度為0.4 μM,過少的引物可能會導致擴增產量低或無擴增,過量的引物可能會導致非特異擴增。
c. 推薦50 μL體系中加入的葉片在1 mm2左右,通過打孔器或剪刀將葉片裁剪至1 mm2大小。
3. 推薦PCR擴增條件:
Step |
Temperature |
Time |
Cycles |
Initial Denaturationa |
98℃ |
2 min~10 min |
1 |
Denaturation |
98℃ |
10 sec |
35 |
Annealing |
50~65℃ |
30 sec |
|
Extensionb |
72℃ |
10~15 sec/kb |
|
Final extension |
72℃ |
5~10 min |
1 |
Hold |
4~16℃ |
Forever |
a. 植物組織裂解後擴增變性時間可縮短至2 min,植物葉片直接擴增變性時間推薦使用10 min。
b. 常規基因組模板推薦延伸速度10~15 s/kb;覆雜模板15~30 s/kb。
注意事項
1. 操作之前,請務必認真閱讀本產品說明書。
2. 盡量使用新鮮植物葉片,否則會影響擴增效率。
3. 如果采用裂解後擴增,樣本的搗碎程度與擴增效率成正比。
4. 擴增1 kb以下的片段直接取1 mm2葉片作為模板,擴增1~2 kb的片段需裂解後取上清作為模板。
5. 2×Plant Direct PCR Master Mix避免反覆凍融,解凍後盡量在一個月內使用完畢。
6. 反應液的配制、分裝請使用新的一次性無酶吸頭、盡量避免樣品間的汙染。
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