1. H-score：即 Histochemistry score（組織化學評分）的縮寫，是處理免疫組化的一種組織學評分方法，將每張切片內陽性面積比率及其染色強度轉化為相應的數值，達到對組織免疫染色陽性深淺和陽性多少兩方面進行綜合半定量分析的目的。H-Score（∑ (pi × i)）= (percentage of weak intensity cells × 1)+(percentage of moderate intensity cells × 2)+(percentage of strong intensity cells×3)，式中 i 表示陽性面積等級劃分：陰性無著色，計 0 分；弱陽性淡黃色，計 1 分；中度陽性棕黃色，計 2 分；強陽性棕褐色計 3 分。pi 表示相應等級的陽性面積百分比。H-score 為 0-300 之間的數值，數值越大說明陽性深淺和陽性多少兩方面綜合陽性強度越強。適用範圍最為廣泛。
2. 平均光密度值 =累積光密度值IOD/陽性像素面積。反映陽性信號的平均深淺，用陽性深淺評價陽性強弱。適用於陽性成片且廣泛表達的情況。
3. 陽性面積比 = 陽性面積/組織面積。反映陽性面積的多少，適用於陽性成片且廣泛表達的情況。例如：AD 模型腦組織 AB 陽性澱粉樣蛋白沉積範圍多少的分析。
4. 陽性面密度 =累積光密度值IOD/組織像素面積。反映待測量組織區域內陽性的平均深淺，適用於組織上陽性成片表達且分布不均勻的情況。
