讓Servicebio成為您的WB實驗小幫手
WB真的是生命科學中研究蛋白質分子傳遞相關的重要實驗,但該注意且不可控的因素真的太多了!
希望這篇文章能幫助到您,讓您的WB跑得更漂亮
一、實驗概述
WB(Western Blot,蛋白免疫印跡)是一種常規的蛋白質分析技術,常用於鑑定某種蛋白,並能對蛋白進行定性和半定量分析。
WB實驗的基本核心概念是抗原抗體的特異性反應,透過SDS-PAGE 將不同分子量的蛋白質分離開,然後轉移到PVDF 膜上,再用脫脂牛奶進行Blocking後,再將抗體用一抗稀釋液進行稀釋。待目的蛋白和抗體充分結合後,用TBST/PBST 洗掉多餘未結合的一抗,加入帶有HRP 標記的對應二抗,這樣,我們的蛋白+一抗+二抗形成一個複合物,加入ECL,有被HPR抓到的蛋白位置就會產生冷光,利用膠片或者冷光成像儀就可以顯現靶蛋白的條帶顯現。
WB常規實驗流程:
蛋白萃取→蛋白定量→製膠→電泳→轉膜→封閉→一抗孵育→一抗洗脫→二抗孵育→二抗洗脫→化學發光→數據分析。
以上繁雜的步驟通常需要2-3天的時間,蛋白質的保存真的是稍縱即逝,所以我們必須搭配良好的試劑與儀器來進行實驗喔!
二、WB實驗試劑配置
RIPA lysis buffer (G2002-100ML或G2033-100ML)
分成強與弱兩種裂解液,讓您針對不同樣本有更好的裂解能力
Phosphoprotease Inhibitor (G2007-1ML)
本產品含有多種磷酸酶抑制劑,可有效抑制Serine、Tyrosine和Threonine、酸性磷酸酶、鹼性磷酸酶等細胞內常見的磷酸酶
Bradford Protein Quantitative Assay Kit (G2001)
Bradford法測定蛋白濃度不受絕大部分樣本中的化學物質的影響,樣品中β-巰基乙醇的濃度可高達1 mM,二硫蘇糖醇的濃度可高達5 mM;但受略高濃度的去垢劑影響,需確保SDS含量低於0.01%,Triton X-100含量低於0.05%,Tween-20,Tween-600.1en-60.009%。
50× Protease inhibitor Cocktail (G2006-250UL)
含多種蛋白酶抑制劑,該產品會增加單獨的EDTA,供選擇性使用
BCA Protein Quantitative Detection Kit (G2026)
BCA法不受大部分樣品中化學物質的影響,可以相容於樣品中高濃度去垢劑,包括5%的SDS,5%的Triton X-100,5%的Tween-20、60、80等。
細胞刮勺或組織均質機
針對不同樣本採用不同物理方法進行萃取,可參考我們的另一篇文章『Servicebio WB儀器一條龍 』
三、實驗步驟
A. 組織蛋白萃取
1. 準備所需數量的樣本管;放入研磨珠,置於冰上備用
2. 組織塊先用預冷PBS洗滌2-3 次,除去血以及組織髒汙,然後放在濾紙上,吸盡多餘的PBS 後放入對應的樣本管中,加入約10 倍樣本體積的RIPA lysis buffer (G2002-100ML或G2033-100ML),置於超低溫組織研磨儀(SWE-FP)中,對稱放置,確認放置平衡後,蓋好蓋子,選擇對應的程序開始研磨組織。
1. 芝麻大小的組織,一般加入100-200uL Lysis buffer;綠豆大小組織加入400-600uL Lysis buffer ;黃豆大小組織加入800-1000uLLysis buffer 。
2. Servicebio組織研磨儀參考參數:2mm 氧化鋯珠8-12顆,頻率6.5m/s,時間30s。若一次研磨不徹底,可以再研磨)。如果組織塊比較大,可提前用剪刀將組織塊剪碎。
B. 懸浮細胞蛋白萃取
1. 將細胞放入15mL 離心管(EP-1501-J)中,4℃,2000rpm,離心5分鐘,去除上清液
2. 加入1mL PBS 溶液(G4202-500ML)回溶細胞,將細胞轉移到1.5mL 離心管(EP-150-M)中,4℃,2000rpm,離心5分鐘,去除上清,保留沉澱,重複此步驟2-3 次(此步驟目的為細胞中殘留的培養基)清洗乾淨
3. 根據細胞沉澱的量加入適量的RIPA lysis buffer,例如沉澱體積為綠豆大小(大概10uL 左右)的加入約200μL RIPA lysis buffer,加入適量研磨珠,放入超低溫組織研磨儀(SWE-FP)進行Lysis;
4. Lysis完成後,12000rpm,4℃,離心10分鐘,上清即為蛋白溶液。
C. 懸浮細胞蛋白萃取
1. 沿著細胞培養盤側面或Flask瓶口慢慢加入PBS 溶液,輕輕晃動平皿或培養瓶,然後將細胞培養盤/瓶傾斜放置,輕輕吸除殘餘液體,盡量輕柔,不要將細胞沖掉,清洗2-3 次,最後一次將殘餘PBS 完全吸乾;
2. 加入適當體積的RIPA lysis buffer(例如6 Well單孔細胞長滿的話,加入約250μL完全裂解液),反覆晃動細胞培養盤/瓶,讓裂解液與細胞完全接觸,用細胞刮勺將細胞刮下來,收集後,可加入研磨珠,放入超低溫組織研磨儀(SWE-FP)中進行更完全的Lysis;
3. Lysis 完成後,12000rpm,4℃,離心10分鐘,上清即為蛋白溶液
D. 蛋白定量
1. 配置BSA標準品,取1 mL蛋白標準配製液加入蛋白標準品(BSA)蛋白標準管中,將25 mg蛋白標準品完全溶解,即得到濃度為25 mg/mL的蛋白標準貯備液。配製成的蛋白標準溶液可-20℃長期保存。
2. 取適量25 mg/mL BSA標準品,以PBS或生理食鹽水稀釋50倍,得到終濃度0.5 mg/mL的蛋白質標準工作液。注意稀釋時依10倍梯度法稀釋,確保稀釋準確。
3. 將蛋白標準工作液分別以0、1、2、4、8、12、16、20 μL加到96孔板中,再以PBS或生理食鹽水依序加入20、19、18、16、12、8、4、0 μL將上述梯度工作液補足至20 μL。得到蛋白濃度依序為0、25、50、100、200、300、400、500 μg/mL的梯度曲線。
4. 將待測的蛋白樣品進行適當稀釋(可透過預實驗檢測,使樣品蛋白濃度在標準曲線範圍內,確保檢測結果可信),並依照每個樣品20 μL的量加到96孔板中。待測樣品與蛋白標準品用相同溶液稀釋。
5. 將BCA試劑與硫酸銅溶液依50:1體積比充分混合均勻,得到BCA顯色工作液。 BCA顯色工作液可室溫保存,24 h內使用。每個待測樣本需200 μL,建議按需配製,避免浪費。
6. 向標準曲線樣品孔及待測樣品孔中每孔加入BCA顯色工作液200 μL,充分混勻(可將96孔板放在振盪器上振盪30 s),37℃反應30 min後,以標準曲線0號做參比,在562 nm波長下比色測定,記錄各各孔吸光度值。 (註:也可以在室溫反應2 h,或60℃反應30 min。如果蛋白濃度較低,建議置於60℃反應)
7. 以標準曲線中梯度蛋白含量(μg/mL)為橫座標,吸光值為縱座標,繪出標準曲線。根據所測樣品的吸光值,在標準曲線上即可查得對應孔中待測樣品的蛋白濃度(μg/mL),再乘以樣品稀釋倍數即為待測樣品實際蛋白濃度。